[Sypherot]

Сселе
Эта таинственная организация существовала задолго до Второго Удара, но уже тогда имела информацию абсолютно обо всем. Их информация основывается на Свитках Мертвого Моря (эти свитки были предназначены когда-то для членов секты и должны были подготовить их, как "Детей Света" для борьбы человечества с Богом и ангелами в грядущем Апокалипсисе). В организацию входят представители сильнейших стран, возглавляет ее Keel Lorenz, который так же является председателем комитета "Завершения Эволюции Человечества".
У главы Seele есть свои планы на Третий Удар, о которых не знают даже остальные члены организации...
Эмблема Seele - семь глаз Лилит.
Нерв
Nerv - это международная организация, созданная в 2010 году Seele и ООН для защиты от ангелов. Весь персонал перешел в Nerv из Gehirn. Главная штаб-квартира Nerv находится в Геофронте, под Токио-3. Nerv имеет ветви в Гемании, США и других странах. Главнокомандующий - Гендо Икари.
Эмблема Nerv состоит из изображения, названия и девиза. Девиз ("God`s in his heaven. All`s right with the world.") позаимствован у Роберта Браунина, поэта 19 века. Изображение, половинка фигового листа - символ первородного греха.
Гехирн
Gehirn - предшественник Nerv`а. Этот проект начался в 2003 году вместе с проектом "Е". Руководителем стал Гендо Икари. Но душой проекта была его жена, Юи. Это она посвятила его в тайны Seele и ввела в проект. Создание Ев было ее идеей и научной работой. В 2010 году Gehirn преобразовался в Nerv.
Seele создал эту организацию для создания новой жизненной формы - Евангелионов, которые были необходимы для планов Кила Лоренца.
Мардук
Marduk - организация для поиска и отбора подходящих для пилотирования детей. Так как синхронизироваться с Евами способны только родившиеся после Второго Удара дети, то и отбор ведется среди школьников. Сначала кажется забавным, что свое внимание Marduk сосредоточил на детях Муниципальной Школы №1 Токио-3, но потом этому появляется объяснение - эта школа и есть Marduk Из 108 отделений органицации 106 были липой. А оставшиеся два подчинялись Seele и Nerv, то есть, как сказал Каджи, самой организации никогда не существовало...
Совет Мардука: Ikari Gendo, Fuyutsuki Kouzou (President), Lorenz Keel, Shouichi Takahashi, Kimio Chiba.